從Streptomycestsukubaensis發酵得到。

　　發酵過程如下：將100m1種子液(含1%甘油，1%玉米淀粉，0.5%葡萄糖，1%棉子粉，0.5%玉米浸漬液和0.2%碳酸鈣，pH=6.5)移入500ml瓶中，在120℃下消毒30min。接入一圈經斜面培養的S．TsukubaensisNo．9993種子，在30℃下培養4天。將該培養液移入裝有201。

　　相同種子液的、已于120℃：消毒過30min的30L發酵罐中，在30℃下培養2天，鼓人空氣2L/min，攪拌300r/min。將16L該培養液植入裝有1600L發酵液(含4.5%可溶性淀粉，1%玉米浸漬液，1%干酵母，0.1%碳酸鈣和0.1%Adekancd，pH=6.8)的、已在120℃消毒過30min的2000L，罐中，在30℃、170r/min攪拌和1600L/min的空氣流下發酵4天。

分離：1500L發酵液用25kg硅藻土輔助下過濾。濾餅用500L丙酮提取，提取液和濾液(1350L)合并，通過裝有100LDiaionHP-20非離子吸收樹脂(Mitsubishi(2hemicalIndustriesLtd，．Japan產品)的柱子。

　　用300L水和300L50%丙酮水溶液洗后，再用75%丙酮水溶液洗脫。洗脫液在減壓下濃縮至約剩300L水溶液，再用20L乙酸乙酯提取3次。提取液合并，減壓濃縮至剩油狀物。

　　該油狀剩余物和2倍重量的酸性硅膠(specialsilicagelgrade12，Fuji(9evisionCo，Japan產品)混合后，浸人乙酸乙酯中。蒸出溶劑，剩余的干燥粉末用8L同樣的酸性硅膠柱層析，用30L正己烷、30L正己烷和乙酸乙酯(4：1)混合液、30L乙酸乙酯洗脫。收集含富吉霉素的洗脫液，減壓濃縮。

　　油狀剩余物和2倍重量的酸性硅膠混合，浸入乙酸乙酯中。蒸出溶劑，產生的干燥粉末用3.5L酸性硅膠柱層析，用10L正己烷、10L正己烷和乙酸乙酯(4：1)混合液、10L乙酸乙酯洗脫。收集含富吉霉素的洗脫液，減壓濃縮。得到的黃色油狀剩余物溶于300ml正己烷和乙酸乙酯(1：1)的混合液中，用2L硅膠(230～400μm，MerckCo．，Ltd．IJSA產品)柱層析，用正己烷和乙酸乙酯(先10L1：1，后6L1：2)、6L乙酸乙酯洗脫。

　　收集含富吉霉素的洗脫液，減壓濃縮，得到34g白色粉末狀的富吉霉素。將其溶于乙腈，減壓濃縮。濃縮液在5℃放置過夜，得到22.7g棱狀的結晶。再用乙腈重結晶，得到13.6g無色棱狀結晶的純的富吉霉素。